ИЗСЛЕДВАНИЯ
Анна Бош, координатор на IDIBAPS Biobank, и Verónica Fernández, технически координатор на CIBERDEM Biorepository
Биохранилището за диабет и метаболитни заболявания функционира като смесена платформа CIBERDEM-IDIBAPS, която е интегрирана в IDIBAPS Biobank. Това е научно-технологична инфраструктура, която координира събирането, обработката, съхранението и трансфера на биологични проби за напредъка на научните изследвания в областта на диабета и свързаните с него метаболитни заболявания. Анна Бош, координатор на IDIBAPS Biobank, и Verónica Fernández, технически координатор на CIBERDEM Biorepository, представят в това интервю баланса и прогнозата на тази платформа.
-Едно от стратегическите действия на CIBERDEM беше да насърчи създаването на голямо референтно Биохранилище на проби от диабет и свързаните с него метаболитни заболявания. Доколко е постигнат напредък в този проект и какви са предизвикателствата, които все още предстоят за него?
- Биохранилището CIBERDEM е може би най-пълната колекция от биоизточници на метаболитни заболявания в Южна Европа, фокусирана главно върху диабета и затлъстяването. В момента има проби от повече от 11 000 донори, както засегнати от някаква патология, така и здрави контроли. Една от особеностите на тази голяма колекция е, че тя разполага и с широк спектър от клинични, семейни и епидемиологични данни, перфектно записани и достъпни за изследователската общност, които позволяват реализирането на големи проекти за транслационна медицина, които би било трудно да се постигнат от отделни изследователски групи.
-Какво означава наличието на CIBERDEM-IDIBAPS Биохранилище за диабет и метаболитни заболявания за изследователите на CIBERDEM?
- Изследователите на CIBERDEM разполагат с целия каталог с проби и данни безплатно. Фактът, че колекцията вече е на разположение, означава, че изследователите не трябва да отделят време от проектите си за планиране и подготовка на колекцията, а могат директно да анализират пробите.
-Колко проби са на разположение и какъв тип са те?
-Разполагаме с богат каталог на метаболитни патологии, главно на различни видове диабет (тип 1, 2, гестационен и моногенен) и затлъстяване (затлъстяване и морбидно затлъстяване), както беше споменато по-горе, но също така и на дислипидемия, преддиабетна популация (проучване PREDAPS), общо контролират популацията и специфична колекция от древна ДНК. По същия начин имаме важна колекция от проби от общата популация, включени в проучването [email protected]. Донорите на пробите идват главно от Андалусия, Каталуния, Валенсийската общност, Мадрид, Страната на баските и Ла Риоха, като получават общо над 50 000 проби от серум, плазма, ДНК и лимфоцити.
-Как работи и как се управляват пробите?
-Центровете за сътрудничество са отговорни за подписването на информираното съгласие от донора, получаването на пробата и записването на свързаните данни. Ако е необходимо, обработка на първоначалната проба може да се извърши и на мястото на събиране (тъй като някои процеси трябва да се извършат незабавно по време на извличането на пробата). Впоследствие пробите се изпращат до IDIBAPS Biobank, където останалата част от обработката ще бъде извършена и биоресурсите ще бъдат съхранявани следвайки най-строгите критерии за качество както при обработката на пробите, така и при тяхното управление. Всички проби се съхраняват в множество аликвотни части и на поне две различни места, за да се гарантира качеството на пробите и да се избегнат загуби поради потенциални инциденти.
-Общо 13 центъра в Испания предоставят мостри, отворени ли са за повече сътрудничество?
-Разбира се. Биохранилището CIBERDEM е отворено както за нови проекти, така и за включване на нови центрове. В случай на нови предложения, Научният комитет на Биохранилището ще ги проучи подробно, за да оцени тяхната жизнеспособност.
-Какъв тип проучвания правят възможни тези проби?
- Поради характеристиките на колекцията, която включва голямо разнообразие и количество проби, е възможно да се извършват големи проучвания, които не биха били възможни чрез дейността на отделни изследователски групи.
-Пробите са придружени от клинични и демографски данни, които позволяват провеждането на епидемиологични проучвания. Какви изследвания от този тип са стартирани въз основа на тези проби?
-Повечето от аликвотните трансфери са за проекти от проучването [email protected], чиято основна цел е да се изследва епидемиологията на диабет тип 2. В тези проучвания са анализирани възможните биомаркери, свързани със заболяването, генетичните и епигенетичните фактори в развитието му, както и други фактори от интерес (ролята на мастните киселини и физическите упражнения в развитието на болестта, например).
-Базата данни BCGENE също е стартирана за интегриране на наличните данни с генетични и геномни данни, какви предимства предоставя този инструмент?
-Базата данни е още един ресурс, достъпен за общността CIBERDEM, който позволява статистическата експлоатация на епидемиологични данни, свързани с пробите, въз основа на множество параметри. Ако се счете за необходимо, геномните данни, получени от пробите, също могат да бъдат интегрирани.
-Пробите са достъпни за всеки следовател, който ги поиска. Търсят ли се много?
-В момента, през 8-годишната история на Биохранилището, имаме заявки за проби за повече от 30 изследователски проекта. Повечето изследвания, които са поискали проби, принадлежат към средата на CIBERDEM, което е логично, като се има предвид, че говорим за мрежа, която обединява най-забележителните изследователи на национално ниво в областта на метаболитните заболявания. Въпреки това, пробите на Biorepository са на разположение за всеки изследователски проект, който е одобрен от външните комитети на IDIBAPS Biobank и Научния комитет на CIBERDEM Biorepository.
-Какъв е балансът до момента на научната дейност, осъществявана с подкрепата на тази смесена платформа?
-Балансът е много положителен, тъй като резултатите от проектите, в които са използвани проби от Биохранилището, са публикувани в поне 15 публикации с голямо въздействие.
-Съществува ли и сътрудничество с изследователи от други тематични области на CIBER?
-Не засега, но със сигурност ще бъде чудесен залог за в бъдеще.