представлява

Джесика Гринууд

  • Член
  • 20 ноември 2019 г.
  • 960

Замисляли ли сте се дали сърдечните заболявания имат генетичен компонент? А какво да кажем за диабет тип 2? Или рак на гърдата? Съществува нова техника, която има за цел да комбинира ДНК тестването с техники за математическо моделиране, за да отговори на същия въпрос на лично ниво. Нарича се полигенен резултат (PRS). Но какво точно е полигенният резултат?

По дефиниция „полигенен“ означава „повече от един ген“. И за разлика от много дефиниции в областта на здравето, това точно описва значението му. Някои здравословни състояния са моногенни, което означава, че са причинени от патогенен или болестотворен вариант в един ген. Например, муковисцидозата е моногенно състояние, което се причинява от единична мутация в CFTR гена. Въпреки че има стотици моногенни условия, общият брой на хората, засегнати от някое от тези условия, е доста малък. От друга страна, общи черти, като затлъстяване и хипертония и заболявания като сърдечни заболявания и диабет, засягат значителен брой от населението на света. Предразположението към тези черти и заболявания всъщност се контролира от комбинация от много гени. По това определение те са полигенни. За да предоставим точна оценка на риска от тези състояния, трябва да разгледаме индивидуалните рискове, които човек има на много места в генома, и да ги комбинираме. Кумулативният резултат от тези комбинирани рискове се нарича полигенен резултат.

Как се изчислява оценката на полигенния риск?

Как се изчислява PRP? За да се определи полигенен рейтинг на риска, първо е необходимо да се оцени комбинираният риск в стотици, хиляди или дори милиони варианти. Всеки от тези варианти обикновено допринася в малка степен за общия риск от заболяването. За да определим този глобален риск, трябва да разработим модел за това как да добавим приноса на всички тези варианти заедно.

Математическият модел, използван за изчисляване на PRP, отчита две неща: вариантите, намерени във вашата ДНК, и въздействието, което всеки от тези варианти има върху вероятността да развиете болестта.

Знанието кои варианти да опитате идва от изчерпателен преглед на така наречените изследвания на геномната асоциация, GWAS (произнася се „G-wahs“) накратко. Проучванията на GWAS включват хиляди до милиони хора, обикновено от конкретна етническа популация, някои от които имат въпросната болест или сложна черта. Милиони варианти на техните геноми се анализират и резултатите на тези, които имат заболяването, се сравняват с тези, които нямат, за да се види как техните варианти се различават. Това създава картина на вариантите, които са най-често срещани при хората с болестта и ни казва кои варианти да търсим в ДНК пробата, изпратена от здравен комплект.

Всеки вариант има уникален принос за общия риск от заболяването. Това се нарича „размер на ефекта“. Математическият модел взема предвид този размер на ефекта, като дава на вариантите с по-големи размери на ефекта по-голямо тегло от тези с по-малки размери на ефекта. Следователно, когато се подаде проба, тя се тества за вариантите, идентифицирани в проучванията на GWAS, и резултатите се въвеждат в модела. Моделът изчислява размера на ефекта за всеки вариант и оценява съответния риск. PRS е сумата от индивидуалните рискове във всеки от тези варианти.

Съображения с PRP

Понастоящем докладите за PRP са достъпни само за хора от европейски произход. Това е така, защото по-голямата част от проведените проучвания на GWAS се фокусират предимно върху хора от този етнически произход. Тъй като може да има разлики във вариантите, които причиняват болестта между хората от различни етнически групи, са необходими проучвания на GWAS във всяка основна етническа група, преди PRP да може да бъде надеждно изчислена за хора от неевропейски произход. За щастие по целия свят се предприемат мащабни изследователски усилия, които се опитват да се справят с този проблем. След като тези данни бъдат публикувани, докладите за PRP ще бъдат достъпни за други етнически групи.

Другото нещо, което трябва да имате предвид при PRP, е, че е най-ценно, когато се разглежда като част от цялостна картина на здравето. Условия като сърдечни заболявания и затлъстяване до голяма степен се влияят от фактори на начина на живот като диета, упражнения и ИТМ, които можете да контролирате. PRS е ръководство, което помага да се идентифицират хора, които може да не са знаели, че са изложени на генетичен риск, позволявайки на тях и техните доставчици на здравни услуги да бъдат по-активни в грижите си.