Какво се случва, когато учен чуе или прочете глупости. Безплатен начин за възмущение. Не е подходящ за фина кожа.

научно

Понеделник, 9 май 2016 г.

Клетва, Валирийски стоманен меч, изкован от Лед, великият меч на семейство Старк, от Тайвин Ланистър.
Дадено на сина й Хайме, капитан на Кралската гвардия, а по-късно и на Бриен дьо Тарт. Източник.


Състав и части на меча

Меч Нокът, от Джон Сноу, пред антитяло
Важно е, преди да се знае откъде идват антителата, какви части ги съставят. Вече обясних накратко тази част преди, когато говорихме за ХИВ. Обаче там малко отпадна, така че мисля, че е необходимо да поговорим малко по-задълбочено за тях, за да ги разберем напълно. Точно както в меч острието се кова, полира, заточва и се издълбават кръстът, дръжката и козината, антителата преминават през процес на коване.

На листа могат да се различат и различни части. Мнозина, за да облекчат тежестта, имат жлеб в центъра, наричан още кух. Понякога вместо широка кухина може да отнеме две по-тесни, което леко увеличава теглото на меча в сравнение с тези, които съдържат една-единствена по-широка кухина. В нашето антитяло, антиген-свързващи фрагменти (Fab) ще бъде листът, тъй като именно той ще се свърже с патогена. The променлив парче (Fv) ще действа като режещ ръб и като паратоп ще бъде върхът.

Валирианска стомана от антитела

Тежка верига

Тежка верига на имуноглобулин G (IgG). Техен
3 постоянни домейна и CDR в променливия домейн.

Стоманата на нашите антитела, суровината, от която ще тръгнем, са техните тежки вериги. По същество това е протеинова верига с променлива дължина, в която могат да се разграничат до четири константни домена, в зависимост от изотипа на имуноглобулина и един променлив домен. Първите определят семейството антитела, към които принадлежи имуноглобулинът (има пет, които ще видим в следващата глава). Променливите домени са от съществено значение за свързването на антигена и имат 3 допълващи се определящи области или CDR, които ще формират част от паратоп, т.е. регионът, който ще се свърже с епитопа. Тази променлива област е различна във всяка В-клетка, произвеждаща антитела, но ще бъде еднаква във всички В-клетки, които произлизат от един и същ родител, т.е., клонинги.

Константните домейни ще идентифицират не само класа на имуноглобулина, но те са уникални за видовете, към които принадлежи имуноглобулинът. Това означава, че постоянните домейни на тежките вериги на човешки IgG, например, са общи за целия човешки вид. Това е важно не само при пасивния трансфер на антитела при лечението на заболявания и производството на ваксини или по пътя на майката и бебето, но също така и в лабораторни и диагностични приложения, където сме се възползвали от ролята на антителата.

Лека верига

Лека верига на IgG. Показани са вашите два домейна и CDR.

Както в случая с тежката верига, и в леката верига можем да намерим два домейна, един константен и един променлив. За разлика от тежката верига, леката верига има само един постоянен домейн, вместо 3 или 4. Има два вида постоянен домейн, домейнът κ и домейнът λ. В други тетраподи има σ домейн, който е загубен в еволюцията между земноводни и влечуги.

Всеки В лимфоцит произвежда уникален тип лека верига, тоест двете рамена на Y ще носят една и съща лека верига. Тъй като всеки В лимфоцит ще произведе само една тежка верига, както видяхме преди, и една лека верига, комбинацията от вериги ще бъде специфична за всяка В клетка.Антитялото, което произвежда единична В клетка, е известно като антитяло. моноклонални защото идва от един клон. От това следва, че всяка В клетка ще разпознае един и само един епитоп, точно като всяка една от своите дъщери.

Сглобяване на оръжие

Вече имаме готова суровина. Знаем какви компоненти има нашата стомана, коя къща я е поръчала и кой ще бъде този, който ще борави с оръжието. Време е да го сглобите, да му придадете желаната форма и да се надявате, че клиентът е доволен от него.

Кристализиращ се фрагмент или Fc

Fc фрагмент от IgG. Схемата показва домейните
константи 2 и 3 от двете тежки вериги.
Fc фрагментът на антитяло се получава чрез смилане на споменатото антитяло с папаин. Това е частта от антитялото, която ще взаимодейства с Fc рецепторите на В клетките и фагоцитите. Това взаимодействие между клетките и антитялото в крайна сметка ще предизвика смъртта на патогена или заразената клетка, или чрез фагоцитоза, или чрез антитяло-медиирана цитотоксичност. Състои се от 2 или 3 постоянни домена на тежките вериги на антитялото, в зависимост от въпросния изотип на имуноглобулина.

„Орнаментите“ са много важни за дръжките на нашите антитела. Ако погледнете изображенията на Клетва или Нокът, копърът и ястребите имат много любопитни форми и това създава асоциация между меча и неговия носител; по същия начин, Лед, великият меч на Старките, имаше трезвостта, характерна за къщата на Уинтерфел. Нокът, когато е собственост на лорд-командир Жор Мормонт, той е имал мечешка глава за украшение. Да стане нощ, мечът на Къща Харлоу, васал на Сивите, носи лунен камък.

По същия начин, Fc фрагментът от антитела носи свои собствени орнаменти. По-конкретно, те са N-гликозилиране.Например, IgG имуноглобулините имат силно запазено място на гликозилиране. Остатъците от захар, наречени N-глюкозамини, ще се свържат с тези места, образувайки комплекси между аминокиселини и захари, които са характерни за всяко антитяло. Но тези захари не са само за да го направят красиво. Всъщност гликозилирането на Fc на антителата е от съществено значение при взаимодействието между фрагмента и неговите клетъчни рецептори. Fc рецепторите присъстват върху В клетки, NK клетки, еозинофили, фагоцити и мастоцити и те ще предизвикат освобождаването от тези клетки на вещества, които ще смилат, разграждат и елиминират различни патогени.

Антиген-свързващ фрагмент или Fab

Fab фрагмент от IgG. Верижката е показана в оранжево
светлина и лилаво променливите и константните домейни 1 на
тежка верига. Показани са CDR контури.

Тези CDR всъщност представляват коващата работа на антитялото. На наковалнята и чука стоманата ще се сгъва отново и отново, докато се оформи в крайното острие, придавайки на острието окончателната му форма. Броят на гънките, съставът и чистотата на метала и температурата, при която той е оформен, ще предизвикат различни характеристики в меча. Е хиперпроменлива област, всеки придобива свои собствени свойства в своя синтез. В антитялото CDR са вериги във верижната структура, гънки, ако искате. Във всеки случай CDR3 е най-променливата част от всеки паратоп.

Искам да благодаря на Iker Alejo, експерт по мечове, неговите коментари, помощта и корекциите му по време на подготовката на тази статия.