Тематично хранилище за микробиоми

страници

  • Въпроси
  • Билети
  • Проекти
  • Изследвания
  • Означава
  • Видеоклипове
  • Автори
  • Библиография

Четвъртък, 8 февруари 2018 г.

4. Променя ли се микробиотата със сезонната диета?

променете

Фигура 1. Съставите на микробната общност на Hadza червата са циклични и могат да бъдат диференцирани по сезон.

(A) Индивидуални композиции от микрофлора на чревната хадза през 2013 г. - късно-сухо (n = 41, светло зелено), 2014-рано-влажно (n = 19, лилаво), 2014-късно-влажно (n = 58, светло лилаво), Подсезони 2014-рано-сухо (n = 30, светло синьо) и 2014-късно-сухо (n = 40, тъмно зелено), нанесени върху нетеглен график UnoFrac PCoA (ляв панел). Пробите, събрани през сухия сезон, се различават от пробите от мокрия сезон (P <3 × 10-15 и P <3-16, Wilcoxon), докато пробите от сухия сезон са неясни (P = 0,15, Wilcoxon) (десен панел)

(E) Линеен дискриминантен анализ, контролиран учебен подход, който използва линейна комбинация от характеристики, за да максимизира разделянето на класовете, успешно разделя подраздели, с изключение на сухите сезони. Дължината и посоката на стрелките показват нормализираните скали за всяка от характеристиките (OTU).

Следователно данните от Hadza показват както обогатяването на функцията за основните компоненти на диетата през сезоните, така и запазването на функцията през два сухи сухи сезона. Използваме ненасочена метаболомика, независим от последователността подход, за да генерираме високоразмерен „пръстов отпечатък“ на функционалността на общността (26). Тези данни също отлично разграничават сезоните, използвайки методи за учене без надзор (Фигура S4D), но не правят разлика между двата сухи сезона.


Чудехме се как нашите микробиотични профили на 350 проби от хадза, които събрахме, в сравнение с други традиционни и индустриализирани популации. Анализирахме композиционни данни за 18 популации от 16 държави, получени от 26 кохорти, използвайки таксономични разпределения (Таблица S5). 18-те популации бяха разделени по първата основна координата, съответстваща на модернизацията (фигура 3 и фигури S1 и S6, A и B).
---