МАДРИД, 23 юни (EUROPA PRESS) -

свързан

Ген, за който преди се подозираше, че оказва най-голямо генетично влияние върху затлъстяването при хората, всъщност няма нищо общо с телесното тегло, заключава ново проучване, ръководено от изследователи от Харвардското медицинско училище (HMS).

Работата не само отменя един от основните изводи за генетиката на затлъстяването, но също така предоставя първите ефективни начини за анализ на „особено неразрешими и объркващи“ части от генома, като локуса на този ген, казва авторът на главния автор от изследването, Стивън Маккарол, асистент по генетика в HMS.

Техниките, описани в статията, публикувана в понеделник в списание Nature Genetics, трябва да помогнат на учените да изяснят дали гените в подобно сложни региони са свързани с болестта, според изследователите.

Генът AMY1 кодира ензим, който помага на хората да превърнат нишестето в захар. Въпреки че други ензими също изпълняват тази функция, AMY1 започва този процес в слюнката. Именно това прави бисквитките сладки на вкус, след като са били достатъчно дълго в устата ви.

Хората имат различен брой копия на гена AMY1 и различни количества на ензима. „Има известни спекулации, че тъй като този ензим помага за набавянето на хранителни вещества от храната ни, той може да бъде свързан със затлъстяването“, обяснява Кристина Ашър, студент в лабораторията на McCarroll и първи автор на статията.

Съавторът Джоел Хиршхорн, професор по педиатрия в Детска болница в Бостън и професор по генетика в HMS, изучава генетичните варианти, които влияят на затлъстяването. Преди няколко години той се интересуваше дали AMY1 е един от гените, които играят роля.

Той анализира данните за асоцииране на генома, събрани от консорциума GIANT, и не открива връзка между AMY1 и индекса на телесна маса (ИТМ), мярка за теглото на човек спрямо височината му. Но тъй като регионът на генома беше толкова сложен, като AMY1 варираше толкова широко (от две до 14 или повече копия на човек), той не беше сигурен, че данните му разказват цялата история.

Той се обърна към Маккарол, за да види дали могат да се обединят, за да отговорят на въпроса. „Имаме опит в генетиката на затлъстяването и екипът на Стив е експерт в този вид сложни вариации“, казва Хиршхорн. Хиршхорн постави проблема на изчакване, докато лабораторията на McCarroll работи за разработване на инструменти, които могат да открият региона, съдържащ AMY1. "Тази част от генома излезе извън границите на това, което генетиката и молекулярната биология могат да направят", каза Маккарол.

Това не попречи на учените да опитат. През 2014 г. свързан международен екип съобщи в „Nature Genetics“, че AMY1 има връзка със затлъстяването и по съществен начин. Според изследователите хората с по-малко от четири копия на AMY1 са имали около 8% по-висок риск от затлъстяване, отколкото хората с повече от девет копия. AMY1 изглеждаше защитен.

Те вярваха, че изследването на Hirschhorn не е открило връзката, тъй като е предназначено да анализира прости варианти, наречени SNP, а AMY1 е твърде сложен. Междувременно екипът на McCarroll е разработил молекулярни и математически стратегии за анализ на сложни вариации като AMY1 и иска да хвърли втори поглед върху резултатите на другата група.

Използвайки новоразработени молекулярни техники, Usher получи копия на числени измервания на AMY1 и околните геномни структури с безпрецедентни подробности. След това той разработи статистическа рамка, за да намери основни модели, които обясняват данните.

В началото регионът изглеждаше „невероятно сложен“, казва Маккарол. Но Ашър откри, че широкият диапазон на вариациите има по-просто обяснение: Има девет често срещани форми на AMY1 и повечето хора имат някаква комбинация от две от тях.

Новите техники позволиха на екипа на McCarroll и Hirschhorn да изследват биологичното значение на AMY1 с по-голяма точност, отколкото е било възможно преди. И когато изчерпаха своя анализ на геномите на около 4500 европейци с набор от индекси на телесна маса, AMY1 нямаше връзка с по-висок или по-нисък индекс на телесна маса.

Въпреки че идентифицирането на гени, свързани с болестта, е от решаващо значение за профилактика и лечение, изключването на гени също е важно, според авторите. Научаването кои гени си струва да се проследяват, помага на учените да не губят години труд и други ресурси. Когато инструментите за разбиране на сложни варианти станат достъпни, McCarroll и Hirschhorn вярват, че на въпроси като тези около AMY1 ще се отговори по-лесно.

"В човешкия геном има стотици локуси с такъв вид сложност. Те са били като черни дупки в разбирането на човешкия геном", подчертава Маккарол. "Ако AMY1 беше прост вариант, би било наистина изненадващо да видим противоположни резултати като този. Установихме най-добрите практики за идентифициране и потвърждаване на прости варианти, но не и за сложни варианти", заключава Хиршхорн.