Внимание: Тази страница е превод на тази страница първоначално на английски. Моля, обърнете внимание, тъй като преводите се генерират от машини, не че всички преводи ще бъдат перфектни. Този уебсайт и неговите страници са предназначени за четене на английски език. Всички преводи на този уебсайт и неговите уеб страници могат да бъдат неточни и неточни изцяло или частично. Този превод е предоставен за удобство.

азиатския

¿Можете ли да дадете кратко представяне на азиатския чернодробен метил, Opisthorchis viverrini? Как този паразит заразява хората?

Opisthorchis viverrini е ендемичен паразит на плоския червей (или чернодробен метил) в Тайланд, Лаосската народнодемократична република, Виетнам и Камбоджа. Хората са заразени с този паразит, когато ядат камбала, закопчана в неправилно приготвена/консервирана сладководна риба.

Веднъж изядени, стадият на ларвите навлиза в човешкия жлъчен канал, където се развива в възрастен човек, пребиваващ в жлъчния канал в продължение на няколко години. Възрастните произвеждат яйца, които преминават по изпражненията, навлизат в сладководни води и се поглъщат от воден гостоприемник охлюв.

Вътре в охлюва тези паразити се развиват в разсейващ се стадий, който оставя охлюва и енцистира в мускула на сладководни риби, завършвайки сложния им жизнен цикъл.

Настоящият бюджет предполага, че близо 10 милиона души са заразени с тези паразити в цяла Югоизточна Азия.

При човешката описторхоза на жлъчните пътища причинява, viverrini del O., заболяване, свързано с увеличен черен дроб, възпаление на черния дроб и рак на черния дроб (холангиокарцином; CCA), фатален рак на билиарното дърво, с много лоша прогноза.

Допринася ли този паразит за рак на черния дроб?

Opisthorchis viverrini той е класифициран като канцероген от клас I. Все още не знаем точните механизми, които участват, въпреки че изследователите смятат, че няколко фактора допринасят за развитието на рак.

Например, възпалението на гостоприемника, причинено от клетъчно увреждане или клетъчна смърт, свързано с хранене на паразити и/или агрегация, вероятно допринася за канцерогенезата.

Освен това, скорошни доказателства сочат това viverrini del O. секретират протеини, които пряко насърчават клетъчния растеж и развитието на тумора.

Друг фактор, за който се смята, че допринася за туморогенезата, е увреждането на ДНК, причинено от диета, богата на нитрозамини, мощен човешки канцероген от клас I. Заедно тези фактори създават „перфектна буря“ в човешкия жлъчен канал, което води до висока честота на черния дроб рак.

Наскоро бе съобщено, че геномът на живата азиатска камбала е сортиран. Какво означава това?

Международният екип, включващ паразитолози и експерти по геномика от Университета в Мелбърн (Австралия), Сингапурския институт за геном (Сингапур), Университета Khon Kaen (Тайланд) и Пекинския институт за геномика (Китай), участва в геномната последователност и анотиране.

Първо извлечихме геномна ДНК от viverrini del O. и ние използваме машини за секвениране с висока производителност, за да създадем опаковката от над 60 геномни гънки като малки серийни фрагменти. След това тези малки фрагменти бяха монтирани на геномни скелета. В тези големи скелета на генома, всеки регион на гена беше определен и анотиран.

След това бяха използвани редица инструменти за предсказване на функцията на всеки ген в viverrini del O., включително ключови молекули, свързани с метаболизма и тяхната адаптация към живота в човешкия жлъчен канал.

Кои бяха основните предизвикателства при характеризирането на най-големия изучен досега геном на паразитни червеи?

Най-голямото предизвикателство беше наличието на голям брой ретранслаторни елементи, открити в геномната ДНК на viverrini del O.

Например само 3,4% от генома съдържат генетични кодиращи информация протеини. За разлика от тях, повече от 30% от генома съдържат повтарящи се елементи, присъстващи на повече от едно място в генома. Този монтаж означаваше, че е предизвикателен.

За щастие успяхме да използваме новия софтуер (наречен Opera), разработен от нашите сътрудници от Сингапурския институт по геномика.

Използвайки операта, ние създадохме висококачествен геном за въздушен поток, за да оценим функционално фиксирания ген и получихме жизненоважна информация за фундаменталната молекулярна биология на този паразит, включително идентифицирането на основни пътища, свързващи взаимодействията червей-гостоприемник.

Какво разбиране предлага това изследване за това как камбалата оцелява в човешкия жлъчен канал?

Нашето проучване показа, че тези паразити са силно адаптирани към живота в черния дроб, носейки техния брой в жлъчния канал до 10 години.

Например той viverrini del O. е адаптиран да оцелява в среда с ниско съдържание на кислород и е вещ в детоксикацията на вредни състави, като свободни радикали на кислород, освободени в жлъчката по време на липидна пероксидация.

Метаболитните профили на тези паразити също предполагат адаптация за въвеждане в епителните клетки и/или компоненти на жлъчката, които са богати на сложни липиди и протеини. Избягването на имунния отговор от гостоприемника също е важно за тези паразити, особено ако възпалението произтича от клетъчно увреждане, причинено от хранене и/или агрегация. Нашите данни показват, че няколко секретирани молекули могат да модулират имунния отговор на гостоприемника.

Намерихте ли доказателствата, че ниското съдържание на протеини на тези паразити е променило човешката тъкан?

Определихме гените, кодиращи протеините, които други изследователи са показали експериментално, за да променят човешките тъкани. Смята се, че тези молекули (наречени гранулиноподобни молекули) имитират човешки растежни фактори, които насърчават клетъчния растеж.

В нашето проучване открихме и друга неописана гранулиноподобна молекула, която също може да участва в регулирането на клетката. Понастоящем се изследва ролята на тези молекули в насърчаването на рака.

Какви лечения понастоящем се предлагат за инфекция с азиатски чернодробен метил и дали резултатите им вероятно ще доведат до подобрени възможности за лечение?

Най-простата интервенционна стратегия би била да се гарантира, че хората добросъвестно готвят/консервират риба, използвана за консумация от човека. За съжаление културната практика на ядене на сурова риба остава често срещана в много области, въпреки съгласуваните усилия за обучение на общностите относно рисковете, свързани с рибната инфекция. viverrini del O.

Понастоящем няма ваксина за предотвратяване на инфекция и химиотерапията разчита на използването на едно лекарство, празиквантел.

Последните проучвания показват, че прекомерната употреба на празиквантел може да намали ефективността на лечението и да предизвика възпаление на жлъчната система. Нещо повече, дори след успешно лечение, реинфекция с viverrini del O. често срещано е. Алтернативни стратегии за намеса с инфекцията на viverrini del O. така спешно необходимо.

Геномът е важен ресурс, който може да се използва, за да се разбере как действа лекарството или ваксината. Може да се използва и за идентифициране и определяне на приоритети на нови лекарства.

Тъй като тези паразити са трудни за поддържане в лабораторията, първо трябва да се даде приоритет на списъка с лекарствени цели, преди да се предприеме скъпа програма за скрининг на наркотици.

Какво въздействие оказва вашият нов геномен ресурс върху разбирането на други канцерогенни паразити?

В нашето проучване включихме сравнение на геном на O. viverrini до a тясно свързана чернодробна метила, Clonorchis sinensis, a ендемични видове във Виетнам, Китай и Южна Корея и друг паразит, класифициран като канцероген от клас I.

Геномните сравнения разкриха прилики и разлики между тези паразити, включително разлики в секретираните гранулиноподобни молекули, за които се смята, че допринасят за развитието на рак.

Разбирането на биологията на двата чернодробни метила ще подобри нашето разбиране за развитието на рака и ще спомогне за засилване на усилията за контрол на тези червеи, в Югоизточна Азия.

Проучваме и друг важен канцерогенен паразит, Schistosoma haematobium, a кръвен метил, който живее в урогениталните кръвоносни съдове и който заразява стотици милиони хора в Африка на юг от Сахара. Тези паразити са много различни от viverrini del O., и нашите анализи не откриха общи гени, свързани с развитието на рак.

Какви са следващите стъпки във вашето изследване?

Сега преглеждаме геномите на всички плоски червеи и приоритетни гени за насочване с помощта на нашия тръбопровод за откриване на лекарства.

Надяваме се да намерим гени/протеини, които са общи за всички паразити и които могат да бъдат насочени с помощта на съществуващи или нови лекарства. Една от важните ни цели е да предоставим на лекарите по-широк спектър от лекарства за лечение на инфекция.

Освен това ще изследваме новите протеинови семейства, идентифицирани в viverrini del O. за да усъвършенстваме нашето разбиране за това как те могат да живеят в рамките на човешкия жлъчен канал в продължение на няколко години, без да се елиминират от имунната система.

Към днешна дата, когато характеризираме нов геном на паразити, откриваме множество нови протеини, които ни дават представа за техните уникални адаптации към човешкия гостоприемник. Като биолози ние непрекъснато се удивляваме на това, което откриваме, и се вълнуваме от разгадаването на историята.

Къде читателите могат да намерят повече информация?

Наскоро публикувахме генома на viverrini del O. и всички наши открития в комуникациите в природата (DOI: 10.1038/ncomms5378). Можете също така да разберете повече информация за viverrini del O. в уебсайта на Центровете за контрол и превенция на заболяванията (http://www.cdc.gov/parasites/opisthorchis/).

Нийл Йънг е национално здравеопазване и BGI-Shenzhen финансира Професора за ранно кариерно изследване на медицинския съвет (NHMRC), а нашето изследване - Австралийския изследователски съвет, Австралийския NHMRC и. Нашето изследване се подкрепя и от предварителен викториански грант (Grant Life Sciences Number VR0007) за неговото пиково изчислително съоръжение в университета в Мелбърн, инициатива на викторианското правителство.

За д-р Нийл Йънг

Той използва мултидисциплинарен подход за извършване на геномни и молекулярни изследвания, за да характеризира биологията на паразитните плоски червеи (клас Trematoda). Изучавайки тези паразити, той се надява да разбере по-добре тяхната еволюция с човешкия гостоприемник и да допринесе за техния контрол и елиминиране.

Откакто предприема постдокторантското си обучение, той е предприел съвместни изследвания, анализирайки геномни и транскриптомни данни от серия, за да характеризира биологията на широк спектър от важни социално-икономически паразити.

Публикувал е> 40 статии или книги във висококачествена международна рецензирана литература. Текущи проекти, ръководени от д-р Йънг, се отнасят до секвениране на геномите на канцерогенни паразити, както и до усъвършенстване на анотацията и настоящите генни набори, като се използват редица допълващи биоинформативни подходи.

Април Кашин-Гарбут

Април е завършил с първокласна отличие по естествени науки в колежа „Пемброк“, Университета в Кеймбридж. По време на времето си на главен редактор в News-Medical (2012-2017), тя стартира процеса на производство на съдържание и спомогна за увеличаване на читателската аудитория на уебсайта до над 60 милиона посетители годишно. Чрез интервюиране на глобални мисловни лидери в медицината и науките за живота, включително нобелови лауреати, Април развива страст към неврологията и сега работи в Центъра за невронни схеми и поведение в Sainsbury Wellcome, разположен в UCL.

Цитати

Моля, използвайте един от следните формати, за да цитирате тази статия във вашето есе, доклад или доклад:

Кашин-Гарбут, април. (2018, 23 август). Последователност на азиатския геном на чернодробния метил: интервю с д-р Нийл Йънг. Новини-Медицински. Посетен на 07 януари 2021 г. от https://www.news-medical.net/news/20140921/Sequencing-the-Asian-liver-fluke-genome-an-interview-with-Dr-Neil-Young.aspx.

Кашин-Гарбут, април. „Последователност на азиатския геном на чернодробния метил: интервю с д-р Нийл Йънг“. Новини-Медицински. 07 януари 2021 г. .

Кашин-Гарбут, април. „Последователност на азиатския геном на чернодробния метил: интервю с д-р Нийл Йънг“. Новини-Медицински. https://www.news-medical.net/news/20140921/Sequencing-the-Asian-liver-fluke-genome-an-interview-with-Dr-Neil-Young.aspx. (достъп до 07 януари 2021 г.).

Кашин-Гарбут, април. 2018. Последователност на азиатския геном на чернодробния метил: интервю с д-р Нийл Йънг. News-Medical, гледано на 07 януари 2021 г., https://www.news-medical.net/news/20140921/Sequencing-the-Asian-liver-fluke-genome-an-interview-with-Dr-Neil-Young.aspx.

News-Medical.Net предоставя тази медицинска информационна услуга в съответствие с тези условия. Моля, обърнете внимание, че медицинската информация, която се намира на този уебсайт, е предназначена да подкрепя, а не да замества връзката между пациент и лекар/лекар и медицинските съвети, които те могат да предоставят.

News-Medical.net - сайт на AZoNetwork