слюнка

Ампаро Толоса, Генотип

Миналата седмица в САЩ беше одобрен протокол за диагностика на проби от слюнка, който може да опрости откриването на заразените с коронавирус SARS-CoV-2. Новата система, разработена в Йейлския университет, използва проби от слюнка, които се получават много по-лесно и евтино и изисква по-малко реагенти за идентифициране на вируси.

Основната стратегия за ограничаване на коронавируса COVID-19 е да се предотврати предаването му от един човек на друг. За постигането на това има два ключови елемента. От една страна, отговорността на всеки човек е да наблюдава мерките за социално дистанциране и използването на маска. От друга страна, има способността на всяка здравна система бързо да открива заразените и да ги изолира.

Тестовете за откриване на коронавирус са от решаващо значение за ограничаване на разпространението му. Изображение: www.freepik.es

Стандартно откриване: назофарингеален тампон, екстракция на РНК и PCR

Досега най-добрият инструмент за откриване на наличието на вируса при човек е вземането на назофарингеална проба и извършване на PCR, широко известна и утвърдена техника, която усилва наследствения материал на вируса по специфичен начин, докато не бъде откриваем с инструменти, предназначени за такъв ефект.

Вземането на проба за анализ е съществена стъпка и затова се препоръчва назофарингеален тампон, който включва поставяне на тампон в горната част на гърлото. По този начин се събира материал, потенциално заразен с вируса. Впоследствие се извършва извличане на наследствен материал на вируса (РНК) и неговото усилване и откриване.

Тази система има някои ограничения, тъй като изисква обучен персонал за извършване на намазването и подходящ материал (тампони), в допълнение към различни реагенти, чието голямо търсене може да причини проблеми с наличността.

Проби от слюнка като възможен алтернативен вариант

За да разрешат някои от тези проблеми, изследователи от Йейлския университет са разработили SalivaDirect, протокол, който използва слюнка вместо проби от мазка и елиминира стъпката на екстракция на РНК. Екипът представя данни за възможността за използване на слюнка в писмо, публикувано в New England of Journal Medicine, където те показват данни от 495 безсимптомни здравни работници, в които е сравнено изпълнението на двата вида проби, използвайки обичайния метод на Екстракция на РНК и PCR.

От друга страна, изследователите са публикували развитието на SalivaDirect в препринт (статия, която все още не е прегледана от специалисти), публикувана в medRxv. Екипът подчертава на уебсайта си, че това не е комплект, а протокол, който, макар и да опростява стандартно използваните, изисква лаборатории, подготвени за използване в клинична и диагностична среда.

Допълнително предимство на SalivaDirect е, че тъй като е протокол, т.е. набор от инструкции, той е валидиран с различни реагенти и устройства, така че е доста гъвкав за наличието на материали и инструменти във всяка лаборатория. Целта на разработчиците му е да могат да го предоставят свободно на заинтересованите лаборатории, така че те да могат да го прилагат според неговите характеристики. Тези лаборатории трябва да подадат искане за получаване на протокола и след като потвърдят, че отговарят на определени изисквания, ще получат разрешение за употреба.

Американската агенция за регулиране на храните и лекарствата (FDA) одобри използването на SalivaDirect като метод за откриване на SARS-CoV-2 на 15 август. Това приемане беше преиздадено на 28-ми.

Екипът на Йейл не е сам в разработването на стратегии, базирани на тестване на слюнката. FDA наскоро одобри търговския тест, наречен DxTerity SARS-CoV-2 RT PCR CE Test, който също използва този тип проба. Друг пример е този на екипа на Jordi Vila от болницата Clínico de la Universidad de Barcelona, ​​който е разработил метод за анализ на слюнката, който подобно на SalivaDirect не изисква екстракция на РНК. Резултатите на екипа също са на разположение във формат за предпечатка, до публикуване в списание, което включва партньорска проверка.

Различни скринингови тестове в зависимост от целта или обхвата

Тестовете, базирани на слюнка, имат множество предимства, сред които се откроява лекотата на вземане на пробата (подобно на тази при всеки генетичен тест директно към потребителя), което избягва риска от вземане на назофарингеална цитонамазка за медицинския персонал. Тези, които не се нуждаят от стъпката на извличане на РНК, също намаляват количеството работа и реагентите, които трябва да се използват, което би позволило да се извършат повече тестове с по-ниска икономическа цена. Недостатъкът засега е, че те са по-малко точни от стандартните PCR тестове за откриване на SARS-CoV-2. Това означава, че въпреки че в определени контексти като масивни скринингови операции, нови тестове върху проби от слюнка могат да бъдат бърз и лесен метод за разглеждане, в други ситуации като болничната обстановка традиционните тестове ще продължат да се правят. „Преди случай на явно подозрение или в болница се нуждаем от възможно най-надеждна диагноза, така че PCR ще продължи да се използва в назофарингеални мазки“, обясни Жорди Вила пред агенция SINC, „но пробите от слюнката ще ни позволят да достигнем повече хора и повече пъти ".

Ако тази новина ви е харесала и искате да научите повече за генетиката в медицината, интересувате се от нашата курсове Y. Университетско образование.