Вижте статиите и съдържанието, публикувани в този носител, както и електронните резюмета на научни списания към момента на публикуване

diagn

Бъдете информирани по всяко време благодарение на сигнали и новини

Достъп до ексклузивни промоции за абонаменти, стартиране и акредитирани курсове

Днес обновеното и нарастващо значение на инфекциозната патология е общопризнато: поява на нови патогени, резистентни щамове, процеси с неизвестна досега клинична експресия, силно сложни състояния. В същото време клиничната микробиология и инфекциозни болести са претърпели голямо развитие в отговор на предизвикателството, породено от настоящата инфекциозна патология. Инфекциозни болести и клинична микробиология е официалната публикация на испанското общество SEIMC. Той отговаря на научната гаранция на това общество, двойната функция за разпространение на изследователска работа, както клинична, така и микробиологична, отнасяща се до инфекциозна патология, и допринася за непрекъснатото обучение на заинтересованите от тази патология чрез статии, ориентирани към тази цел и подготвени от Top оценени автори, поканени от списанието.

Индексирано в:

Индекс Текущо съдържание/Клинична медицина, JCR, SCI-Expanded, Index Medicus/Medline, Excerpta Medica/EMBASE, IBECS, IME, CANCERLIT, SCOPUS

Следвай ни в:

Импакт факторът измерва средния брой цитати, получени за една година за произведения, публикувани в публикацията през предходните две години.

CiteScore измерва средния брой цитати, получени за публикувана статия. Прочетете още

SJR е престижна метрика, базирана на идеята, че всички цитати не са равни. SJR използва алгоритъм, подобен на ранга на страницата на Google; е количествена и качествена мярка за въздействието на дадена публикация.

SNIP дава възможност за сравнение на въздействието на списанията от различни предметни области, коригирайки разликите в вероятността да бъдат цитирани, които съществуват между списанията на различни теми.

  • Обобщение
  • Ключови думи
  • Резюме
  • Ключови думи
  • Конвенционална микологична диагноза
  • Обобщение
  • Ключови думи
  • Резюме
  • Ключови думи
  • Конвенционална микологична диагноза
  • Молекулярна диагностика
  • Заключения
  • Конфликт на интереси
  • Благодаря
  • Библиография

Диагностиката на инвазивни гъбични инфекции е трудно предизвикателство поради ниската чувствителност на традиционните методи и води до диагностични и терапевтични закъснения. Целите на тази прегледна работа са да обобщят текущото състояние на молекулярните диагностични техники за инвазивни гъбични заболявания и да изяснят реалната роля, която те играят в клиничната практика. Конвенционалните микробиологични методи могат да бъдат допълнени с молекулярни техники, които позволяват по-бързо и точно идентифициране на клиничните изолати. Откриването на биомаркери (β-глюкан, галактоманан) е полезно при имунокомпрометирани пациенти и са диагностични критерии за EORTC/MSG. Откриването на нуклеинова киселина все още е допълнителен диагностичен инструмент, полезен при диагностицирането на плесенни микози. И накрая, комбинираното откриване на биомаркери може да подобри диагнозата, но приложимостта му не е толкова проста и изисква допълнителни проучвания за адекватна оценка на валидността.

Диагностиката на инвазивни микози е трудно предизвикателство поради ограниченията и ниската чувствителност на традиционните микробиологични методи, които водят до диагностични и терапевтични закъснения. Целта на този преглед е да обобщи състоянието на техниката на молекулярната диагностика на инвазивно гъбично заболяване и да изясни настоящата му роля в клиничната практика. Конвенционалните микробиологични методи могат да бъдат допълнени с молекулярни методи за бързо и окончателно идентифициране на гъбични изолати. Биомаркерите (β-глюкан, галактоманан) са много полезни при имунокомпрометирани пациенти и са включени като вероятни инвазивни микози от EORTC/MSG. Понастоящем откриването на нуклеинова киселина се използва като допълнителен инструмент за диагностика. Въпреки това, PCR може да бъде много полезна при инвазивни плесени микози. И накрая, комбинираното откриване с помощта на биомаркери може да подобри диагнозата. Приложимостта им в микробиологичната лаборатория обаче не е толкова лесна и са необходими допълнителни проучвания за подходяща оценка на нейната клинична полезност.

Диагнозата на инвазивни микози продължава да бъде трудно предизвикателство, особено поради ниската специфичност на клиничните прояви, липсата на рентгенологични находки, които са патогномонични, и ниската чувствителност и относителна бавност на микробиологичните методи 1–4. Присъщите ограничения и ниска чувствителност на традиционните микробиологични диагностични методи като микроскопско наблюдение на клинични проби, тяхното култивиране в изкуствени среди и последващо идентифициране на гъбички, изолирани в споменатата среда с различни техники, предполагат диагностично забавяне, което много Понякога забавя въвеждането на най-подходящото противогъбично лечение за гъбичното заболяване, претърпено от пациента, а също така благоприятства появата на необратими органични увреждания. Всъщност различни проучвания свързват високата заболеваемост и смъртност от инвазивни микози с тези закъснения, както диагностични, така и терапевтични 5-7 .

Един от възможните начини за решаване на този диагностичен проблем е разработването на микробиологични техники, които не трябва да се основават на културата на онези клинични проби, които се считат за значими или които, ако се основават на културата и изолирането на патогена, намалете значително времето, необходимо за постигане на идентификация на сигурността на получените гъбични изолати. Освен това, за да бъдат тези диагностични методи ефективни от клинична гледна точка, би било важно те да предоставят ценна допълнителна информация за характеристиките на тези изолати, като тези свойства, свързани с потенциалната резистентност към противогъбични лекарства, фактори на вирулентност или патогенност или епидемиологични данни, които подобряват разбирането на патогенезата и епидемиологията на инвазивните гъбични инфекции.

Наскоро бяха публикувани няколко консенсусни документа и насоки с препоръки за диагностика и лечение на инвазивни гъбични заболявания 2,17–20, и по-специално, Ayats et al 8 публикуваха актуализиран преглед на диагнозата инвазивно гъбично заболяване и предложиха серия от много полезни препоръки. Поради това в този преглед ще се опитаме да отговорим на поставения в заглавието въпрос за това коя лабораторна диагноза е най-подходяща при пациента, за който се подозира, че има инвазивна гъбична инфекция, независимо дали конвенционалната или молекулярната диагноза, или дали в настоящият момент и двете са необходими и допълващи се. За да постигнем тази цел, ще направим кратък преглед на съществуващите методи, подчертавайки техните силни и слаби страни, какви са пресечните точки и кръстопътя между конвенционалната и молекулярната диагностика и какви факти могат да позволят взаимно подсилване, което води до подобрение в диагнозата на инвазивни гъбични инфекции.

Конвенционална микологична диагноза

Сред микологичните диагностични методи, считани за конвенционални, можем да откроим макро и микроскопско изследване на клинични проби, тяхното отглеждане в изкуствени среди, за да може да се изолира причинителят на микоза или оценка на имунния отговор на пациента срещу него, главно чрез откриването на антитела срещу различни специфични гъбични антигени 3,21 .

Автоматизирането на кръвни култури направи възможно съкращаването на времето за диагностика при инвазивни гъбични инфекции, като кандидоза, при които гъбичките са сравнително чести. Трябва обаче да отбележим, че кръвните култури с растеж на Candida продължават да бъдат близо до 50% от случаите на инвазивна кандидоза, цифра, която може ясно да се подобри 44–46. Други инвазивни микози, като фузариоза и есцедоспориаза, могат да се проявят с епизоди на гъбички и кръвни култури позволяват изолирането на гъбичките, но при повечето инвазивни гъбични инфекции, причинени от плесени, добивът на тези култури е много лош 22,45,47, 48. Изолирането на гъбички в хранителни среди, в които са засети клинични проби, които обикновено не са стерилни, като респираторни проби, трябва да се оценява внимателно и в тези случаи е все още по-важно да се направи правилна оценка на клиничната ситуация на пациента. Стойността на клиничния изолат, въпреки че може да е тази на обикновена замърсителна гъба, е много по-висока, ако пациентът отговаря на необходимите клинични условия, за да се счита, че е с висок риск от инвазивна гъбична инфекция.

Идентифицирането на изолираната гъба ще се основава на макроскопичната морфология на колониите и микроскопичната морфология на гъбата и нейните биохимични, физиологични и имунологични свойства 8. Идентифицирането за няколко минути на четири важни вида Candida, като C. albicans, C. dubliniensis, C. glabrata и C. krusei, може да се извърши с тестове за аглутинация на латексни частици 49–51 или за асимилация на трехалоза 52. Амплифицирането и секвенирането на гъбични нуклеинови киселини от клинични изолати или идентификация чрез масова спектрометрия (MALDI-TOF или Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization-Time-Of-Flight) е все по-достъпно, както поради скоростта, така и заради разходите им 13, 38,53–60. Ferroni et al 14 са изследвали полезността на MALDI-TOF за идентифициране на патогени в кръвни култури с интересни и бързи резултати (2 часа). Тези техники изместват традиционните методи за идентификация в много лаборатории и тази молекулярна идентификация е още по-важна за онези гъби, чиято идентификация чрез традиционни методи е ненадеждна, твърде трудоемка или които могат да бъдат извършени само в референтни лаборатории от малък брой експертни миколози 36 .

Откриването на антитела има ограничена полезност при диагностицирането на инвазивни гъбични инфекции. Счита се, че производството на антитела е намалено при имунодефицитни пациенти, което намалява диагностичната полезност на тяхното откриване. Няколко проучвания обаче показват, че това не е обобщен факт и че е възможно да се открият антимицелиеви антитела на C. albicans (CAGTA) чрез ензимен имуноанализ и имунофлуоресценция при онкохематологични пациенти с важен диагностичен и прогностичен потенциал при инвазивна кандидоза 75–78. Втората фаза на многоцентрово проучване е оценка на диагностичната полезност и прогностичната стойност на откриването на CAGTA с помощта на Candida albicans IFA IgG тест (Vircell Laboratories, Испания), при критични пациенти, приети в испански интензивни отделения 79–81. Най-добри резултати обаче са получени чрез комбиниране на откриването на антитела с други техники за откриване на MN или BG 82,83 .

Молекулярната диагностика има голямото предимство, че не е необходимо да се основава на културата на микроорганизма и откриването на гъбични биомаркери предлага голяма надежда в краткосрочен план 8,83. Този априорен факт позволява по-бърза диагностика, тъй като не е необходимо да се изчаква 24-48 часа (понякога седмици), преди да се получат колонии от патогена в хранителната среда. Тази диагноза обаче трябва да има за цел да информира за характеристиките на изолираните гъби в същата пропорция, детайлност и важност, която прави конвенционалната диагноза, което не е толкова просто.

Един от първите молекулярни методи, който демонстрира голяма полезност и ефикасност след комерсиализацията му през 70-те години, е откриването на GXM, капсулен антиген от Cryptococcus neoformans. Различни проучвания и клинична практика в хиляди клинични микробиологични лаборатории са показали голямата диагностична и прогностична полза от откриването на GXM посредством тест за латексна аглутинация или чрез ензимен имуноанализ (ELISA), в цереброспиналната течност или в серума на ХИВ-инфектирани пациенти. AI научни доказателства) 8 или онкохематологични пациенти с менингеална и дисеминирана криптококоза (AII научни доказателства) 12 .

Други методи, разработени впоследствие за откриване на MN от Candida или GM от Aspergillus, не успяват да постигнат подобни диагностични постижения и трябва да се използват с по-голямо внимание в клиничните лаборатории по микробиология. Две скорошни трудове разглеждат задълбочено приноса на серологичните биомаркери, като откриването на MN или антитела срещу Candida, при диагностицирането на инвазивна кандидоза 83,84 .

Научни доказателства за диагностичните препоръки 8